
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物工程 为其提供 TMT蛋白质组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
实验没想到
研究探讨人员管理洞察分析一下随之保鲜冷库时长增长鸡肉的对抗强度、持水程度、背景色、游走铁硫的含量、ROS、脂质过钝化物、MDA、GSH和GPX4的水平来评价指标手臂肌肉阻止受损体细胞的铁自杀阶段。最终结果界面显示,保鲜冷库时长增长后,鸡肉的对抗强度在第四天和第6天可观上升;持水程度减轻;背景色变深,丢掉光滑,鲜桔灰色变的暗桔灰色。除外,游走铁、催化活性氧和MDA的硫的含量可观多,受损体细胞凋亡率可观身高。 科学研究工作人员领取有的差异 冷藏箱精力的身体腹肌打样定制的蛋清质,最后做SDS-PAGE解析,蛋清质条带在有的差异 年间占比不匀且似的(图1a)。可根据蛋清在有的差异 打样定制中的理解情况报告,解析找到相同组打样定制的中五位数快要于相同平行(图1b),表明身体腹肌打样定制蛋清质更具积极的组内似的性和组间的差女性朋友。 淀粉酶质组学共签定出1996种淀粉酶质。以B0为照表组,选择B1、B2、B4和B6中的淀粉酶使用不一表示数据介绍,共签定到375个DEPs。将火山图数据可视化,并给出FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两人标数据介绍DEP。的可是如1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别签定出22、33、73和140个DEPs,其中的分头别上浮6、11、32和85个,变动16、22、41和56个。聚类分析法方案估评了不一冷库第一阶段脂肪阻止中淀粉酶质的表示,的可是显示信息脂肪淀粉酶表示不一跟着保管时长的加大而加大(图1g)。
图1| 不相同冷冻冷藏时的健身肌肉样件球脂肪酸组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种要在冷藏室保存时候的手臂肌肉产品的样品距离血清研究(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁伤亡核蛋白肽的PRM降钙素原检测概述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 应用于KEGG聚集异同表示球蛋白的铁消失逻辑(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物学提供了TMT化学发光法蛋清质组学技术水平设备货品,拜谱生物技术水平已开发做完并实现了建立完善成熟稳重的转录组学、蛋清组学、细胞代谢组学各类几组学携手货品技术水平设备货品模式,欢迎致电咨询!
选取医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.